Ongeacht het type, moet alle chocolade worden opgeslagen in een koele en lage vochtigheidsgraad (droog), uit de buurt van direct zonlicht. Het zou het beste zijn om het te verzegelen in een luchtdichte verpakking, omdat, zoals ElendiTheTall zei, de cacaoboter die erin zit smaken zal absorberen.
Donkere chocolade zal jarenlang meegaan. Melk en witte chocolade gaan veel korter mee (een paar maanden), vanwege hun melkgehalte.
Onjuist bewaarde chocolade zal gaan bloeien, wat te zien is als een witte of grijze streep of vlek op het oppervlak. De vlekken of strepen zijn cacaobotervetafscheidend en zijn een teken dat het temperament van de chocolade verloren is gegaan. Dit soort chocolade is nog steeds geschikt voor elke toepassing waarbij de chocolade volledig gesmolten zal zijn (het meeste bakken). Het kan zelfs worden gebruikt als basischocolade (niet-zaadchocolade) voor het tempereren met de zaaimethode, maar het mag niet worden gebruikt voor andere snoepwerkzaamheden.